目前國內常用的無土栽培基質是：砂粒、礫石,、蛭石,、珍珠巖、泥炭土,、巖棉等,。另外，爐渣,、磚渣,、木炭、鋸木梢,、蕨根,、樹皮和椰糠等也可作基質,。基質在使用前需洗凈或消毒,。
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1、基地環(huán)境保護地：水肥一體化無土栽培,，栽培設施全,，環(huán)境好，栽培環(huán)境可控,，能有效阻隔病蟲害侵染,，沒有過渡期，可直接生產有機蔬菜,；而一般土壤栽培,，無栽培設施或設施不全，環(huán)境好但受環(huán)境影響大,，難以控制病蟲害侵染,，且一般土壤上有機栽培要有2~3 a（年）過渡期。
2,、水肥管理及病蟲害防控：保護地水肥一體化無土栽培技術,，其水肥一體化,肥水均勻，操作簡便,，省工，且病蟲害少,，可人為措施控制,，基地可以長期使用。一般土壤栽培水肥均勻度難控制,，操作麻煩,，費工，且病蟲害多,，難以人為控制,，基地生產多年則病蟲害嚴重。
3,、在無土蔬菜栽培中,，為防止落花落果，調節(jié)植株生長發(fā)育,，可綜合利用生物激素,，噴施乙烯利,、矮壯素、九二o,、增產靈,，濃度要適宜，噴施要均勻,。
4,、生產中應用的肥料：有機生態(tài)型無土栽培和有機基質栽培的肥料主要選用優(yōu)質有機肥， 包括各種消毒糞肥如雞糞,、牛糞,、羊糞、馬糞等,，餅肥如豆餅,、棉籽餅、菜籽餅,、芝麻餅,、花生餅等。
5,、無機肥可選用各種化肥,，尤其是復合肥、緩釋肥,。生產綠色食品或有機食品時,，肥料使用應遵循相關標準的規(guī)定。